住宿登记在公安系统的保留期限如下：
纸质登记
至少保存3年。一些旅馆可能会保存更长时间，例如15年，作为经营凭证。
联网登记
可以永久保存。如果上传至公安系统，技术上可以实现永久保存。
行业规定
3星级以下酒店至少保存90天，5星级酒店至少保存3年。
法律要求
根据《旅馆业治安管理办法》（2011年修订）第7条，住宿登记簿和旅客住宿登记表应当至少保存2年，以备公安机关查阅。
地方实践
各地公安机关根据当地实际情况决定保留时间，没有统一的标准。短期住宿信息可能保存数月甚至一至两年，长期住宿记录可能保存数年。
建议
联网登记：如果宾馆使用联网登记系统，建议确保系统稳定并定期备份数据，以符合永久保存的技术要求。
纸质登记：对于仍然使用纸质登记方式的宾馆，应确保记录至少保存3年，并符合相关法规要求。
保密措施：无论采用何种登记方式，宾馆经营者都应对消费者的个人信息严格保密，并采取必要的技术措施和其他必要措施，确保信息安全。