南京公积金提取的时间间隔如下：
租房提取
每季度可以提取一次，提取时间间隔应大于等于3个月（按90天计算）。
购房提取
首付提取：在签订合同或办证一年内可申请，提取额度不超首付款金额。
偿还贷款购房：每年能提一次，纯公积金贷款提取更便捷，直接对冲还款；商贷则需提供贷款合同、还款流水，按实际还款本息提取，夫妻双方提取总额不超年还款额。
重大疾病提取
每年办理一次，具体时间未明确说明。
其他提取
离休、退休：符合离休、退休条件的，可以申请提取住房公积金本息余额。
建议：
对于租房提取，建议每季度初提前办理提取手续，以确保提取资金及时到账。
对于购房提取，建议在购房合同签订或产权证办理后尽快申请，以确保提取额度和时效性。