在大连，病假工资的扣除主要依据以下几点：
劳动合同约定：
如果劳动合同中明确约定了病假工资的基数，则按照该基数计算。但约定的基数不得低于对应的职位的工资标准。
集体劳动合同：
如果劳动合同中没有约定，但有工会或职工代表，则病假工资的基数可以在集体劳动合同中约定。如果没有工会，则按照当前工资的70%计算。
最低工资标准：
病假工资不得低于当地最低工资标准的80%。
医疗期：
医疗期内停工治疗在6个月以内的，病假工资的计算方式如下：
连续工龄不满2年的，按本人工资的60%计发；
连续工龄满2年不满4年的，按本人工资的70%计发；
连续工龄满4年不满6年的，按本人工资的80%计发；
连续工龄满6年不满8年的，按本人工资的90%计发；
连续工龄满8年及以上的，按本人工资的100%计发。
日工资计算：
病假工资还可以按照“日工资×病假工资比例×病假天数”的公式来发放。日工资是“月工资计算基数÷当月计薪日”的结果。
其他规定：
如果用人单位与劳动者无任何约定，假期工资的计算基数统一按劳动者本人所在岗位（职位）正常出勤的月工资的70%确定。
综上所述，大连病假工资的扣除方式主要依据劳动合同的约定、集体劳动合同的约定、最低工资标准以及医疗期的相关规定。具体计算时，需要考虑劳动者的工龄、病假天数以及是否在医疗期内等因素。建议用人单位和劳动者在签订劳动合同时，明确约定病假工资的基数和计算方式，以避免后续纠纷。