在巢湖处理违章，车主可以选择以下几种方式：
现场处理
携带驾驶证和行驶证到巢湖市各交警大队的秩序科（行政大厅）现场刷卡缴纳罚款。
也可以选择到指定的几个银行缴纳罚款。
异地处理
如果违章发生在异地，车主需要持有《公安交通管理行政处罚决定书》或《公安交通管理简易程序处罚决定书》，到处罚地所在省选择的代理银行在全国任意地的营业网点缴纳罚款。
网上处理
可以通过邮政代办、12580热线代办、公安交警信息网办理等方式处理交通违章扣分。但需要注意的是，网上办理不支持交警现场处理的违章，且处理时间较长，一般需要15个工作日，手续费20-40元不等。
建议车主根据自身情况选择最便捷的处理方式，以节省时间和精力。