防伪税控系统主要包括以下几个子系统：
税务发行子系统：
用于对税务机关使用的专用设备进行逐级发行。
企业发行子系统：
用于对企业开票子系统专用设备进行发行。
发票发售子系统：
用于向企业发售发票。
报税子系统：
用于接收企业报送的报税数据。
认证子系统：
对企业提交的发票抵扣联进行扫描认证。
红字发票管理子系统：
对红字发票信息表进行开具与处理。
防伪开票子系统：
企业使用该系统开具专用发票，必须通过主管防伪税控税务机关发行税控IC卡和金税卡后才能使用。
防伪税控系统通过数字密码技术、智能IC卡、税控黑匣子等技术集成，实现了对增值税发票的防伪和税控，是税收征管的重要高科技手段